蛋白質-蛋白質相互作用方法與應用

前言

　　人類基因組測序的完成標志著一個新的生物學研究時代——后基因組時代(post—genomic era)的來臨。全基因組的序列信息并不足以解釋及推測細胞的各種生命現(xiàn)象，蛋白質才是細胞活性及功能的最終執(zhí)行者，蛋白質之間復雜的相互作用決定著生物體的復雜程度，科學家們的研究熱點又回到了蛋白質上。機體細胞內蛋白質之間相互交叉作用可以從分子水平揭示蛋白質的功能，而且對于提示生長、發(fā)育、分化、凋亡以及理解生物調控機制等生命活動規(guī)律至關重要，為探討重大疾病的機制、疾病治療、疾病預防和新藥開發(fā)提供了重要的理論基礎。因此，了解、闡明蛋白質之間相互作用的機制意義重大，是后基因組時代生命科學與其他學科交叉研究的熱點。

內容概要

　　蛋白質之間無時無刻不在進行著相互作用，從而決定細胞的命運。研究這種相互作用何時發(fā)生、如何發(fā)生，對于我們理解生物過程的分子機制，闡明疾病的分子基礎，確定潛在的治療靶點都是至關重要的。在本書中，頂尖科學家們介紹了他們在研究蛋白質相互作用時運用的技術手段，包括生物化學、生物物理學、遺傳學和計算機等領域的方法。細述了如何確定相互作用的蛋白質，定性或定量測量蛋白質相互作用，在活體細胞中監(jiān)測蛋白質相互作用，測定相互作用界面。所涉及的尖端技術包括表面質粒共振技術、熒光共振能量轉移、熒光極化、等溫滴定量熱法、圓二色分析、蛋白質片段補充試驗、各種雙雜交系統(tǒng)，以及蛋白質組方法和生物信息學方法。所有這些方法均簡單易行，每個實驗操作規(guī)程都經(jīng)過了時間考驗。書中還加入了背景介紹、相應技術背后的原理、所用到的儀器及試劑清單，并給出了解決問題、避免問題的注意事項。    本書具有高度的權威性和實際操作性，為初學者和資深專業(yè)研究人員解析蛋白質如何通過相互作用形成生物學網(wǎng)絡、揭示疾病中發(fā)生的蛋白質相互作用、尋找新的治療靶點，提供了大量強有力的工具。

書籍目錄

第一部分  概述　第1章  蛋白質-蛋白質相互作用的結構基礎　第2章  蛋白質-蛋白質相互作用的定量分析第二部分  離體實驗方法　第3章  等溫滴定熱分析技術檢測蛋白質-蛋白質相互作用　第4章  應用圓二色光譜分析蛋白質-蛋白質相互作用　第5章  核磁共振譜分析蛋白質-蛋白質相互作用　第6章  應用表面等離子共振技術研究視紫紅質-G蛋白相互作用　第7章  使用光散射技術確定蛋白質復合物的化學計量　第8章  沉降平衡研究　第9章  模擬小區(qū)帶凝膠過濾色譜法檢測蛋白質-蛋白質相互作用　第10章  熒光凝膠阻滯實驗檢測蛋白質-蛋白質相互作用　第11章  熒光偏振實驗技術定量研究蛋白質-蛋白質相互作用　第12章  通過印跡疊加或Far Western印跡研究蛋白質-蛋白質相互作用　第13章  GST融合技術研究蛋白質-蛋白質相互作用　第14章  親和毛細管電泳分析蛋白質-蛋白質相互作用在靶向藥物發(fā)現(xiàn)中的應用　第15章  羥基蛋白質足跡法篩選蛋白質-配體相互作用　第16章  利用噬菌體展示和多價大分子技術設計蛋白質-蛋白質相互作用抑制劑第三部分  在異種系統(tǒng)中檢測蛋白質-蛋白質相互作用　第17章  基于轉錄激活的細菌雙雜交系統(tǒng)　第18章  應用酵母雙雜交系統(tǒng)檢測相互作用的蛋白質　第19章  利用雙誘餌酵母雜交系統(tǒng)分析蛋白質-蛋白質相互作用　第20章  用于膜蛋白研究的分裂泛素酵母雙雜交系統(tǒng)　第21章  反向酵母雙雜交技術　第22章  哺乳動物細胞雙雜交分析檢測體內蛋白質-蛋白質相互作用　第23章  對轉染細胞進行免疫共沉淀第四部分  活細胞中蛋白質-蛋白質相互作用　第24章  熒光共振能量轉移顯微技術　第25章  應用流式細胞分析和熒光共振能量轉移檢測活體細胞內分子間相互作用　第26章  熒光相關譜技術——定量檢測分子相互作用的新型技術　第27章  共聚焦顯微鏡檢測細胞內蛋白質的共定位　第28章  蛋白質片段互補法分析生物化學網(wǎng)絡　第29章  細胞內蛋白質交聯(lián)第五部分  基于蛋白質組學的技術　第30章  蛋白質-蛋白質相互作用的計算機預測　第31章  用親和力方法研究磷酸化依賴的相互作用　第32章  蛋白質復合物的雙向凝膠電泳分析　第33章  凝膠電泳分離的相互作用蛋白質用于質譜分析前的樣品制備　第34章  應用固相同位素標記和質譜進行蛋白質定量分析　第35章  研究蛋白質-蛋白質相互作用的網(wǎng)絡資源專業(yè)詞匯英中對照

章節(jié)摘錄

　　第1章　蛋白質一蛋白質相互作用的結構基礎　　Robert C.Liddington　　摘要　　蛋白質間有序的相互作用參與調控細胞內和細胞間的信號轉導。雖然用已知的蛋白質結構可以推導出某些蛋白質-蛋白質相互作用的一般規(guī)律，但是最近對信號轉導過程中形成的蛋白質復合體的結構研究表明，蛋白質相互作用在蛋白質界面的大小和性質方面都具有明顯的多樣性。復合體可分為兩大類：一類是“結構域一結構域”，復合體的兩個組分都含有預先折疊的結構單位；另一類是“結構域肽”，復合體中一種組分是一段短基序(motif)，這段基序沒有與蛋白質結合，是不折疊的。信號轉導復合體通常是由含多個結構域的多種蛋白質組成，而這些蛋白質間的各種結合由分子內結構域的相互作用來調控。本書將探討空間構象變化對蛋白質相互作用調控的結構基礎。

圖書封面

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