蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用方法與應(yīng)用

前言

　　人類基因組測序的完成標(biāo)志著一個新的生物學(xué)研究時代——后基因組時代(post—genomic era)的來臨。全基因組的序列信息并不足以解釋及推測細(xì)胞的各種生命現(xiàn)象，蛋白質(zhì)才是細(xì)胞活性及功能的最終執(zhí)行者，蛋白質(zhì)之間復(fù)雜的相互作用決定著生物體的復(fù)雜程度，科學(xué)家們的研究熱點(diǎn)又回到了蛋白質(zhì)上。機(jī)體細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)之間相互交叉作用可以從分子水平揭示蛋白質(zhì)的功能，而且對于提示生長、發(fā)育、分化、凋亡以及理解生物調(diào)控機(jī)制等生命活動規(guī)律至關(guān)重要，為探討重大疾病的機(jī)制、疾病治療、疾病預(yù)防和新藥開發(fā)提供了重要的理論基礎(chǔ)。因此，了解、闡明蛋白質(zhì)之間相互作用的機(jī)制意義重大，是后基因組時代生命科學(xué)與其他學(xué)科交叉研究的熱點(diǎn)。

內(nèi)容概要

　　蛋白質(zhì)之間無時無刻不在進(jìn)行著相互作用，從而決定細(xì)胞的命運(yùn)。研究這種相互作用何時發(fā)生、如何發(fā)生，對于我們理解生物過程的分子機(jī)制，闡明疾病的分子基礎(chǔ)，確定潛在的治療靶點(diǎn)都是至關(guān)重要的。在本書中，頂尖科學(xué)家們介紹了他們在研究蛋白質(zhì)相互作用時運(yùn)用的技術(shù)手段，包括生物化學(xué)、生物物理學(xué)、遺傳學(xué)和計算機(jī)等領(lǐng)域的方法。細(xì)述了如何確定相互作用的蛋白質(zhì)，定性或定量測量蛋白質(zhì)相互作用，在活體細(xì)胞中監(jiān)測蛋白質(zhì)相互作用，測定相互作用界面。所涉及的尖端技術(shù)包括表面質(zhì)粒共振技術(shù)、熒光共振能量轉(zhuǎn)移、熒光極化、等溫滴定量熱法、圓二色分析、蛋白質(zhì)片段補(bǔ)充試驗、各種雙雜交系統(tǒng)，以及蛋白質(zhì)組方法和生物信息學(xué)方法。所有這些方法均簡單易行，每個實(shí)驗操作規(guī)程都經(jīng)過了時間考驗。書中還加入了背景介紹、相應(yīng)技術(shù)背后的原理、所用到的儀器及試劑清單，并給出了解決問題、避免問題的注意事項。    本書具有高度的權(quán)威性和實(shí)際操作性，為初學(xué)者和資深專業(yè)研究人員解析蛋白質(zhì)如何通過相互作用形成生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)、揭示疾病中發(fā)生的蛋白質(zhì)相互作用、尋找新的治療靶點(diǎn)，提供了大量強(qiáng)有力的工具。

書籍目錄

第一部分  概述　第1章  蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)　第2章  蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的定量分析第二部分  離體實(shí)驗方法　第3章  等溫滴定熱分析技術(shù)檢測蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用　第4章  應(yīng)用圓二色光譜分析蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用　第5章  核磁共振譜分析蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用　第6章  應(yīng)用表面等離子共振技術(shù)研究視紫紅質(zhì)-G蛋白相互作用　第7章  使用光散射技術(shù)確定蛋白質(zhì)復(fù)合物的化學(xué)計量　第8章  沉降平衡研究　第9章  模擬小區(qū)帶凝膠過濾色譜法檢測蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用　第10章  熒光凝膠阻滯實(shí)驗檢測蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用　第11章  熒光偏振實(shí)驗技術(shù)定量研究蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用　第12章  通過印跡疊加或Far Western印跡研究蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用　第13章  GST融合技術(shù)研究蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用　第14章  親和毛細(xì)管電泳分析蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用在靶向藥物發(fā)現(xiàn)中的應(yīng)用　第15章  羥基蛋白質(zhì)足跡法篩選蛋白質(zhì)-配體相互作用　第16章  利用噬菌體展示和多價大分子技術(shù)設(shè)計蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用抑制劑第三部分  在異種系統(tǒng)中檢測蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用　第17章  基于轉(zhuǎn)錄激活的細(xì)菌雙雜交系統(tǒng)　第18章  應(yīng)用酵母雙雜交系統(tǒng)檢測相互作用的蛋白質(zhì)　第19章  利用雙誘餌酵母雜交系統(tǒng)分析蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用　第20章  用于膜蛋白研究的分裂泛素酵母雙雜交系統(tǒng)　第21章  反向酵母雙雜交技術(shù)　第22章  哺乳動物細(xì)胞雙雜交分析檢測體內(nèi)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用　第23章  對轉(zhuǎn)染細(xì)胞進(jìn)行免疫共沉淀第四部分  活細(xì)胞中蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用　第24章  熒光共振能量轉(zhuǎn)移顯微技術(shù)　第25章  應(yīng)用流式細(xì)胞分析和熒光共振能量轉(zhuǎn)移檢測活體細(xì)胞內(nèi)分子間相互作用　第26章  熒光相關(guān)譜技術(shù)——定量檢測分子相互作用的新型技術(shù)　第27章  共聚焦顯微鏡檢測細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的共定位　第28章  蛋白質(zhì)片段互補(bǔ)法分析生物化學(xué)網(wǎng)絡(luò)　第29章  細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)交聯(lián)第五部分  基于蛋白質(zhì)組學(xué)的技術(shù)　第30章  蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的計算機(jī)預(yù)測　第31章  用親和力方法研究磷酸化依賴的相互作用　第32章  蛋白質(zhì)復(fù)合物的雙向凝膠電泳分析　第33章  凝膠電泳分離的相互作用蛋白質(zhì)用于質(zhì)譜分析前的樣品制備　第34章  應(yīng)用固相同位素標(biāo)記和質(zhì)譜進(jìn)行蛋白質(zhì)定量分析　第35章  研究蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的網(wǎng)絡(luò)資源專業(yè)詞匯英中對照

章節(jié)摘錄

　　第1章　蛋白質(zhì)一蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)　　Robert C.Liddington　　摘要　　蛋白質(zhì)間有序的相互作用參與調(diào)控細(xì)胞內(nèi)和細(xì)胞間的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。雖然用已知的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)可以推導(dǎo)出某些蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的一般規(guī)律，但是最近對信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程中形成的蛋白質(zhì)復(fù)合體的結(jié)構(gòu)研究表明，蛋白質(zhì)相互作用在蛋白質(zhì)界面的大小和性質(zhì)方面都具有明顯的多樣性。復(fù)合體可分為兩大類：一類是“結(jié)構(gòu)域一結(jié)構(gòu)域”，復(fù)合體的兩個組分都含有預(yù)先折疊的結(jié)構(gòu)單位；另一類是“結(jié)構(gòu)域肽”，復(fù)合體中一種組分是一段短基序(motif)，這段基序沒有與蛋白質(zhì)結(jié)合，是不折疊的。信號轉(zhuǎn)導(dǎo)復(fù)合體通常是由含多個結(jié)構(gòu)域的多種蛋白質(zhì)組成，而這些蛋白質(zhì)間的各種結(jié)合由分子內(nèi)結(jié)構(gòu)域的相互作用來調(diào)控。本書將探討空間構(gòu)象變化對蛋白質(zhì)相互作用調(diào)控的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。

圖書封面

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