計算機輔助分子生物學實驗設計與分析

出版時間:2009-4  出版社:軍事醫(yī)學科學出版社  作者:李伍舉  頁數:256  

內容概要

  《計算機輔助分子生物學實驗設計與分析》為生物醫(yī)學實驗技術系列叢書分冊之一。全書包含5篇共26章和4個附錄,內容涉及PCR實驗設計、RNA二級結構預測、核酶設計、反義核酸設計、siRNA設計、pBV220載體中外源基因高效表達設計、pPIC9載體中外源基因高效表達設計、B細胞抗原表位預測、T細胞抗原表位預測、蛋白質三級結構預測與顯示、蛋白質功能位點分析、寡核苷酸芯片探針設計、基于基因表達譜的差異基因識別、基于基因表達譜的樣本分類、基于基因表達譜的樣本聚類、利用Perl和Bioperl進行生物信息學分析和利用MatLab進行生物信息學分析等,對加快實驗進程和提高實驗的成功率具有一定幫助?! 】勺鳛榉肿由飳W實驗技術人員的參考書,也可作為在校生物醫(yī)學類本科生與研究生的入門參考書。

書籍目錄

第一篇 生物信息學基礎第1章 生物信息學數據庫簡介第2章 生物信息學軟件簡介第3章 序列比較與進化樹構建第二篇 核酸序列分析第4章 DNA序列翻譯為蛋白質序列第5章 限制性酶切位點分析第6章 轉錄因子結合位點預測第7章 啟動子預測第8章 PCR實驗設計第9章 RNA二級結構預測第10章 核酶設計第11章 反義核酸設計第12章 siRNA設計第13章 大腸桿菌系統(tǒng)pBV220載體中外源基因高效表達設計第14章 酵母系統(tǒng)pPIC9載體中外源基因高效表達設計第三篇 蛋白質序列分析第15章 蛋白質基本性質分析第16章 蛋白質跨膜區(qū)預測第17章 蛋白質信號肽預測第18章 B細胞抗原表位預測第19章 T細胞抗原表位預測第20章 蛋白質功能位點分析第21章 蛋白質二級結構預測第22章 蛋白質三級結構預測與顯示第四篇 基因表達譜分析第23章 寡核苷酸芯片探針設計第24章 基于基因表達譜的差異基因識別.第25章 基于基因表達譜的樣本分類第26章 基于基因表達譜的樣本聚類第五篇 附錄附錄1 利用Perl和Bioperl進行生物信息學分析附錄2 利用MatLab進行生物信息學分析附錄3 BioSun軟件介紹附錄4 相關網址列表結束語

章節(jié)摘錄

  第2章 生物信息學軟件簡介  1 概論  隨著多種類型的海量生物信息數據的產生,從中挖掘生物信息和提取知識,并基于這些知識解決生物學問題的一門新興學科——生物信息學/計算生物學應運而生,其中,以解決生物學問題(理論與實驗兩個方面)為生物信息學/計算生物學的靈魂所在。事實上,對生物醫(yī)學工作者來說,他們主要關心的事是如何利用生物信息學的方法和軟件工具來分析他們在研究中產生的實驗數據和從中提取有生物學意義的信息,為進一步的研究提供幫助,或對實驗進行輔助設計以增加實驗的預見性。因此,開展分子生物學實驗輔助設計的理論研究和軟件設計具有重要意義,可以促進生物醫(yī)學研究逐漸從定性階段走向定量階段,進而加快實驗進程和提高分子生物學研究的效率,使生物信息學成為生物醫(yī)學工作者的得力助手,對生物醫(yī)學研究具有一定的推動作用。  2 生物信息學軟件分類  隨著生物數據規(guī)模的不斷增長,對數據進行綜合分析的難度不斷加大,生物醫(yī)學研究者越來越依賴于生物信息學軟件及相關的服務平臺來進行數據分析。目前,主要有下列三種形式的軟件工具可供利用。  ……

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