非編碼RNA

內容概要

非編碼RNA是不參與蛋白質編碼的RNA的總稱。雖然不參與蛋白質的編碼，但是非編碼RNA卻是RNA實現(xiàn)功能的關鍵。    本書從分子生物學、生物技術、生物信息學和分子醫(yī)學等對非編碼RNA 進行了多角度的介紹。首先對非編碼RNA的結構、性質和功能進行了一個總體評述，目的是討論非編碼RNA的作用和由來；然后對基因組中非編碼RNA 識別的不同方法，形成獨特種類的染色質相關RNA，H19基因，miRNA，RNA 干擾，不同的類型應激誘導的ncRNA，snoRNA等內容進行了介紹。    本書適用于生物技術、醫(yī)學基礎領域從事RNA相關研究的技術人員，也可供相關專業(yè)研究生參考。

書籍目錄

前言第1章 核糖核酸調節(jié)子概述　1.1 引言　1.2 核糖核酸的特性　1.3 編碼和非編碼轉錄物　1.4 RNA調節(jié)子的功能　1.5 展望　參考文獻第2章 內含子和非編碼RNA：真核生物復雜性的隱含層　2.1 引言　2.2 非編碼RNA代表了哺乳動物及幾乎所有復雜生物基因組的主要產物　2.3 內含子和ncRNA是否代表了基因表達的第二個層次　2.4 內含子　2.5 非編碼RNA　2.6 非編碼RNA的起源和命名法　2.7 “基因”的新定義——一個具有順式作用調節(jié)元件的轉錄集合　2.8 涉及RNA的復雜遺傳現(xiàn)象　2.9 RNA結合和信號轉導蛋白　2.10 ncRNA的可能功能　2.11 一個新的遺傳學　參考文獻第3章 基于計算發(fā)現(xiàn)非編碼RNA　3.0 摘要　3.1 引言　3.2 蛋白質編碼基因和ncRNA基因的發(fā)現(xiàn)　3.3 用戶定制的ncRNA基因發(fā)現(xiàn)程序　3.4 可重新配置的ncRNA基因發(fā)現(xiàn)程序　3.5 從頭開始的ncRNA基因發(fā)現(xiàn)——在沒有序列或結構先驗知識的情況下尋找基因　3.6 ncRNA基因預測程序的現(xiàn)狀與展望　致謝　參考文獻第4章 Xist RNA與染色質結合并導致基因沉默　4.0 摘要　4.1 引言　4.2 Xist基因　4.3 胚胎中Xist介導基因沉默的起始　4.4 Xist表達的調控——計數和選擇X染色體　4.5 Xist發(fā)揮功能的機制　4.6 一種Xist功能模型　4.7 關于進化的思考　4.8 結語　參考文獻第5章 果蠅中的劑量補償作用：核蛋白體復合物介導的轉錄上調　5.1 概述　5.2 劑量補償作用的不同機制　5.3 劑量補償作用的基本原則　5.4 通過染色質修飾的雄性特異的高轉錄　5.5 雄性特異劑量補償實現(xiàn)依賴于性別致死抑制子的缺失　5.6 DCC的組成　5.7 roX RNA是染色質進入位點　5.8 DCC的有序組裝　5.9 MSL蛋白的特殊功能以及它們之間的相互作用　5.10 roX RNA是劑量補償所必需的　5.11 模型和展望　參考文獻第6章 H19印跡RNA的結構、調節(jié)和功能　6.0 摘要　6.1 引言　6.2 調節(jié)性RNA　6.3 H19的印跡　6.4 H19的組織特異性表達　6.5 H19的保守序列　6.6 H19與生長控制　6.7 H19 RNA是否有功能？　參考文獻第7章 microRNA　7.0 摘要　7.1 引言　7.2 miRNA的發(fā)現(xiàn)和分離　7.3 miRNA的特征　7.4 lin-4的作用機制　7.5 參與miRNA產生與功能的蛋白質　7.6 尋找miRNA的靶位點　7.7 人工miRNA　7.8 結語　參考文獻第8章 siRNA和miRNA：微小，但是強大　8.0 摘要　8.1 micoRNA　8.2 小干擾RNA　8.3 siRNA引發(fā)RNAi的應用　參考文獻第9章 植物中的轉錄后基因沉默　9.0 摘要　9.1 引言　9.2 多條途徑產生雙鏈RNA起始植物PTGS　9.3 從dsRNA到RNA降解途徑的沉默模型　9.4 PTGS在植物中的作用　9.5 結論　參考文獻第10章 RNA指導的DNA甲基化及染色質修飾　10.0 摘要　10.1 引言　10.2 同源依賴的基因沉默　10.3 RNA指導的DNA甲基化(RdDM)現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)及其特征　10.4 RdDM的分子機制　10.5 RNA指導的染色質修飾　10.6 RNA沉默的進化機制　10.7 展望　致謝　參考文獻第11章 腦特異的非信使RNA　11.0 摘要　11.1 引言　11.2 腦內的大分子nmRNA　11.3 腦內的snmRNA　11.4 展望　致謝　參考文獻第12章 snoRNA世界的新領域　12.0 摘要　12.1 引言　12.2 修飾指導snoRNA的兩大家族　12.3 snoRNP的生成　12.4 指導snRNA修飾的新snoRNA　12.5 尋找RNA靶點時發(fā)現(xiàn)的孤兒snoRNA　12.6 腦特異的印跡snoRNA　12.7 修飾指導snoRNA的古菌同源物　12.8 古菌tRNA同樣是靶點　12.9 結語　致謝　補充證據　參考文獻第13章 植物細胞中非編碼RNA或短可讀框編碼RNA研究的新進展　13.0 摘要　13.1 存在于植物和動物中沒有長ORF的mRNA　13.2 僅含有sORF的mRNA參與植物的生長和發(fā)育　13.3 作用的可能機制　13.4 展望：小調控RNA和sORF編碼的寡肽作為新基因表達調控子　參考文獻第14章 發(fā)育活化和應激誘導的非編碼黑腹果蠅hsrw基因整合其他核轉錄物的翻譯后加工　　14.0 摘要　14.1 引言　14.2 果蠅中93D或入hsrw基因表現(xiàn)出獨特和保守的可誘導性，但顯然不產生蛋白質　　14.3 果蠅中入hsrw基因具有獨特的保守結構，卻很少有堿基序列保守　14.4 hsrw基因產生多個非編碼轉錄物　14.5 hsrw基因在發(fā)育過程中廣泛表達　14.6 hsrw基因啟動子區(qū)是復合體　14.7 盡管是非編碼轉錄物，hsrw是有功能的　14.8 hsrw轉錄物的功能　14.9 未來展望　致謝　參考文獻第15章 adapt基因的RNA轉錄物作為核糖核酸調節(jié)子　15.0 摘要　15.1 背景　15.2 adapt15和adapt33的鑒定　15.3 adapt15和adapt33的作用機制　15.4 結語　參考文獻第16章 顯性非編碼微衛(wèi)星擴展紊亂中RNA的致病機制　16.0 摘要　16.1 引言　16.2 Ⅰ型肌強直性營養(yǎng)不良：基因的發(fā)現(xiàn)和致病模型的提出　16.3 8型脊髓小腦共濟失調　16.4 10型脊髓小腦共濟失調　16.5 DM1、SCA8和SCA10之間臨床和分子上的差別　16.6 Ⅱ型肌強直性營養(yǎng)不良　16.7 肌強直性營養(yǎng)不良中RNA的致病機制　16.8 其他非編碼擴展失調　16.9 總結　參考文獻第17章 由細菌染色體編碼的非編碼RNA　17.0 摘要　17.1 概述　17.2 引言　17.3 持家sRNA　17.4 調控的反義RNA進入兩種境地　17.5 反式編碼的反義RNA MicF是一個應激反應的調控因子　17.6 sRNA可以調控多個基因　17.7 一個調控RNA——兩個(或多個)靶RNA　17.8 多個RNA作用于同一個靶　17.9 sRNA的另一個作用：破壞同一個操縱子下的基因協(xié)調表達　17.10 某些sRNA需要輔助蛋白　17.11 例外(？)：E.coli染色體順式編碼反義RNA　17.12 通過sRNA和蛋白質間相互作用調控基因表達　17.13 sRNA的結構　17.14 細胞中穩(wěn)定或不穩(wěn)定？　17.15 初級或加工后轉錄本　17.16 新sRNA的作用是什么？　17.17 通過什么樣的機制發(fā)揮作用？　17.18 有多少個sRNA？　17.19 結論　致謝　參考文獻第18章 我們數量眾多：非編碼調節(jié)RNA和Hfq　18.0 摘要　18.1 非編碼RNA　18.2 非編碼RNA在革蘭陰性菌中的功能　18.3 革蘭陽性細菌中非編碼RNA　18.4 調節(jié)調節(jié)子。ncRNA如何被調節(jié)？　18.5 RNA結合蛋白Hfq與ncRNA　18.6 Hfq的功能如何？　18.7 Hfq如何與RNA相互作用？　18.8 結論　致謝　參考文獻中西文對照索引

章節(jié)摘錄

　　第1章　核糖核酸調節(jié)概述　　1.1　引言　　生物體重要的功能之一是基因表達的調節(jié)。研究特異基因轉錄物的調節(jié)機制是了解環(huán)境改變、發(fā)育及疾病所致的生物學現(xiàn)象改變的關鍵因素?；虮磉_的調節(jié)模式異常復雜且極其多樣，然而對于每一個特定的基因都有各自特定的信號決定其表達的開啟和關閉及表達產物量的多少。無論是為了適應新環(huán)境還是適應生物進化所需的基因調節(jié)都具有很強的靈活性?！　≡缙诘挠^點認為生物系統(tǒng)都是遵循著1958年Francis Crick提出的“分子生物學中心法則”　(central dogma of molecular biology)。中心法則講述了儲存在DNA中的遺傳信息表達的一般性的通路，DNA轉錄生成瞬時的信使RNA并在核糖體中在適體RNA(tRNA)的幫助下翻譯生成細胞生命活動所需的酶蛋白和各種結構功能蛋白質。因此，核糖核酸被看作是執(zhí)行基本附屬功能的分子，而且許多蛋白質編碼的基因定義了生物體的復雜性?；蜃鳛镈NA上的一段序列，編碼蛋白質遵循著一個基因一種蛋白質(多肽)的原則。在后來的研究中發(fā)現(xiàn)除了編碼蛋白質的序列(外顯子)之外，基因還包括非翻譯的部分(內含子)，而內含子在剪接加工過程中被去除而不存在于初級轉錄物之中。許多例證都表明，可變剪接使得同一個基因轉錄物可以加工生成不同的蛋白質。一個重要的突破點是研究發(fā)現(xiàn)一些小的RNA分子可以行使催化的功能。核糖核酸酶P的RNA和自我剪接內含子能夠在蛋白質缺失的情況下介導復合體化學反應和RNA成熟。此后，應運而生的SELEX技術就是體外選擇具有催化功能結構域和配體結合特性的RNA分子的技術。所有這些發(fā)現(xiàn)都有助于更好的識別RNA分子的化學特性及其所形成的復雜的三級結構，這也是行使不同功能的蛋白質之所以具有特殊結構域的基礎。此外，早期研究進展表明rRNA并不只是核糖體蛋白的結構支架，在多肽的形成和核糖體其他許多功能方面還發(fā)揮著重要功能。

編輯推薦

　　本書是由波蘭科學院的Jan Barciszewski教授和德國自由大學的VolkerA.Erdmann教授主編的第一本全面系統(tǒng)闡述非編碼RNA研究領域和研究進展的專著，該書從分子生物學、生物技術、生物信息學和分子醫(yī)學等對非編碼RNA進行了多角度的介紹，具體內容包括核糖核酸調節(jié)子概述、基于計算發(fā)現(xiàn)非編碼RNA、microRNA、植物中的轉錄后基因沉默、RNA指導的DNA甲基化及染色質修飾等。該書可供從事相關工作的人員作為參考用書使用。

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