生物信息學(xué)實(shí)踐基礎(chǔ)教程

內(nèi)容概要

本書從初學(xué)者及應(yīng)用的角度對(duì)生物信息學(xué)分析所涉及的幾個(gè)方面進(jìn)行了介紹，提供了一些重要的常用軟件的基本性能、獲取方法和簡(jiǎn)單的使用步驟，力圖通過最簡(jiǎn)單直觀的方式使初學(xué)者能在最短的時(shí)間內(nèi)了解生物信息學(xué)軟件的基本功能，而不著眼于對(duì)軟件功能以及所涉及算法的全面介紹。全書共分為四章，從計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)知識(shí)入手，以核酸和蛋白質(zhì)序列分析為重點(diǎn)，由淺入深地介紹涉及核酸與蛋白質(zhì)序列分析與研究的各個(gè)方面。    本書是在西南交通大學(xué)實(shí)驗(yàn)室及設(shè)備管理處“323基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)教學(xué)平臺(tái)”建設(shè)項(xiàng)目的資助下，由生命科學(xué)與工程學(xué)院生物系生物信息學(xué)專業(yè)部分師生集體編著，面向生物信息學(xué)軟件的初學(xué)者，是一本實(shí)用性極強(qiáng)的操作指南。本書內(nèi)容新穎、語(yǔ)言流暢、圖文并茂、篇幅適當(dāng)，操作實(shí)例具體而典型，可作為生命科學(xué)各專業(yè)本科生、研究生實(shí)驗(yàn)教材，也可供其他專業(yè)師生和科研人員以及廣大生物信息學(xué)入門和提高的讀者參考使用。

書籍目錄

第一章　計(jì)算機(jī)應(yīng)用基礎(chǔ)  第一節(jié)　Word的使用  第二節(jié)　Excel的使用  第三節(jié)　Foxmail的使用與設(shè)置  第四節(jié)　Linux操作系統(tǒng)簡(jiǎn)介  第五節(jié)　數(shù)據(jù)庫(kù)的設(shè)計(jì)、制作和應(yīng)用第二章　分子生物學(xué)基礎(chǔ)  第一節(jié)　序列格式轉(zhuǎn)換  第二節(jié)  序列分析——BioEdit  第三節(jié)  序列分析——cLc Free Workbench  第四節(jié)　序列分析——Accelrys Gene  第五節(jié)  引物設(shè)計(jì)——PriIner Premier  第六節(jié)　DNA序列的多態(tài)性分析  第七節(jié)　凝膠電泳圖像分析第三章　生物信息學(xué)軟件　第一節(jié)  多序列比對(duì)——Clustal X　第二節(jié)　進(jìn)化分析　第三節(jié)　蛋白質(zhì)分析　第四節(jié)　蛋白質(zhì)生物信息分析的基本技術(shù)與方法　第五節(jié)　蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)顯示　第六節(jié)　三維結(jié)構(gòu)比較　第七節(jié)　系統(tǒng)發(fā)育樹的顯示與打印第四章　生物信息學(xué)網(wǎng)絡(luò)資源　第一節(jié)　生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)　第二節(jié)　GCG Wisconsin軟件包　第三節(jié)　文本數(shù)據(jù)挖掘分析

章節(jié)摘錄

　　第一章　計(jì)算機(jī)應(yīng)用基礎(chǔ)　　第二節(jié)　Excel的使用　　Excel是以二維表格作為基本的操作界面提供給用戶，用戶通過在表格中輸入數(shù)據(jù)，由程序自動(dòng)完成諸如計(jì)算等功能，同時(shí)電子表格還具有數(shù)據(jù)庫(kù)處理功能。因此，電子表格被廣泛應(yīng)用于統(tǒng)計(jì)分析、財(cái)務(wù)分析、經(jīng)濟(jì)、行政等各個(gè)領(lǐng)域?！　∫?、Excel的一些基本概念和操作　　1.Excel的基本概念　?。?）工作簿：Excel所處理的文檔稱為工作簿，它是一個(gè)運(yùn)算和存儲(chǔ)數(shù)據(jù)的文件，可以在一個(gè)工作簿中管理各種類型的相關(guān)信息。Excel文件的后綴為“.xls”?！　。?）工作表：可以把Excel的工作簿理解為一個(gè)賬本，賬本中的一頁(yè)在Excel中稱為一個(gè)工作表。Excel 2003的工作表是由65 536行x256列組成的巨型表格。工作表用來(lái)列出數(shù)據(jù)和分析數(shù)據(jù)，表中可以存放圖表、對(duì)話框、程序等。　　一個(gè)工作簿可以包括多個(gè)工作表，Excel 2003默認(rèn)為每個(gè)工作簿打開3個(gè)工作表，每個(gè)工作表有一個(gè)名字，稱為工作表標(biāo)簽，系統(tǒng)把它們記為sheetl，sheet2，…在一個(gè)工作簿中最多可以建立255個(gè)工作表?！　。?）單元格：工作表中的每一個(gè)表格稱為單元格，它是組成工作表的最小單位。用戶輸入的任何數(shù)據(jù)都是存放在單元格中的，這些數(shù)據(jù)可以是數(shù)字、公式、文字、圖形、聲音等?！　。?）單元格地址：為了確定單元格的位置，給表格的行和列建立了坐標(biāo)，列坐標(biāo)從左至右標(biāo)記為A，B，C，…，共256列，行坐標(biāo)從上至下標(biāo)記為1，2，3，…，共65 536行。單元格的坐標(biāo)稱為單元格地址，如A4。有時(shí)為了區(qū)分不同工作表中的單元格，可在地址前加上工作表名稱，如sheetl！A8?！　　?/pre>








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