簡明蛋白質(zhì)組學(xué)

內(nèi)容概要

　　《簡明蛋白質(zhì)組學(xué)》共9章，即緒論、蛋白質(zhì)組學(xué)研究技術(shù)、蛋白質(zhì)雙向電泳技術(shù)、生物質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)技術(shù)、蛋白質(zhì)翻譯后修飾、蛋白質(zhì)組學(xué)的定量研究技術(shù)、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析技術(shù)、互作蛋白質(zhì)組研究技術(shù)、蛋白質(zhì)組信息學(xué)。教材力爭理論和實(shí)驗(yàn)技術(shù)的結(jié)合，使學(xué)生不但懂理論，而且會實(shí)踐。同時，每個章節(jié)后附有思考題，便于學(xué)生復(fù)習(xí)和思考。
　　《簡明蛋白質(zhì)組學(xué)》可供生物科學(xué)、生物信息學(xué)等專業(yè)本科生和研究生使用。

書籍目錄

前 言
第1章 緒論
 1.1 蛋白質(zhì)組學(xué)的產(chǎn)生
 1.1.1 蛋白質(zhì)組學(xué)的產(chǎn)生
 1.1.2 蛋白質(zhì)組學(xué)與傳統(tǒng)蛋白質(zhì)化學(xué)
 1.2 蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展
 1.2.1 蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展特色
 1.2.2 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究內(nèi)容
 1.2.3 蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展新趨勢
 本章小結(jié)
 思考題
 參考文獻(xiàn)
第2章 蛋白質(zhì)組學(xué)研究技術(shù)
 2.1 表達(dá)蛋白質(zhì)組學(xué)
 2.1.1 蛋白質(zhì)提取技術(shù)
 2.1.2 蛋白質(zhì)分離技術(shù)
 2.1.3 蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)
 2.2，功能蛋白質(zhì)組學(xué)
 2.2.1 酵母雙雜交
 2.2.2 蛋白質(zhì)芯片技術(shù)
 2.3 結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組學(xué)
 2.3.1 X射線晶體衍射圖譜法
 2.3.2 核磁共振
 本章小結(jié)
 思考題
 參考文獻(xiàn)
第3章 蛋白質(zhì)雙向電泳技術(shù)
 3.1 蛋白質(zhì)樣品制備的基本方法
 3.1.1 樣品的破碎與裂解
 3.1.2 蛋白質(zhì)的沉淀
 3.1.3 蛋白質(zhì)組分的純化
 3.1.4 裂解液的組成成分及其作用
 3.1.5 蛋白質(zhì)的定量
 3.2 蛋白質(zhì)分步提取及亞細(xì)胞蛋白質(zhì)提取
 3.2.1 蛋白質(zhì)一步提取法
 3.2.2 蛋白質(zhì)分步順序提取法
 3.2.3 亞細(xì)胞蛋白質(zhì)提取
 3.3 一維等電聚焦電泳
 3.3.1 蛋白質(zhì)是兩性電解質(zhì)
 3.3.2 pH梯度的形成
 3.3.3 等電聚焦電泳
 3.3.4 等電聚焦技術(shù)類型及其特點(diǎn)
 3.3.5 固相pH梯度技術(shù)
 3.4 二維SDS-聚丙烯酰氨凝膠電泳
 3.4.1 二維SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳的原理
 3.4.2 雙向凝膠電泳技術(shù)的局限性及改進(jìn)方法
 3.5 凝膠的染色、圖形獲取與分析
 3.5.1 凝膠的染色
 3.5.2 2-DE數(shù)字化圖像的處理
 3.5.3 蛋白質(zhì)膠上酶解
 本章小結(jié)
 思考題
 參考文獻(xiàn)
第4章 生物質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)技術(shù)
 4.1 概述
 4.1.1 生物質(zhì)譜儀的基本組成
 4.1.2 生物質(zhì)譜儀的關(guān)鍵性能指標(biāo)
 4.2 基質(zhì)輔助激光解吸電離質(zhì)譜
 4.2.1 離子化源
 4.2.2 TOF質(zhì)量檢測器
 4.3 電噴霧離子化質(zhì)譜
 4.3.1 ESI工作原理
 4.3.2 質(zhì)譜與其他技術(shù)的串聯(lián)使用
 4.4 肽質(zhì)量指紋圖譜鑒定蛋白質(zhì)技術(shù)
 4.4.1 肽質(zhì)量指紋圖譜鑒定蛋白質(zhì)
 4.4.2 肽質(zhì)量指紋圖譜的優(yōu)點(diǎn)及其局限性
 4.4.3 PMF檢索工具
 4.4.4 PSD肽片段的部分測序技術(shù)
 4.5 串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)鑒定蛋白質(zhì)技術(shù)
 4.5.1 串聯(lián)質(zhì)譜測定多肽序列原理
 4.5.2 串聯(lián)質(zhì)譜的優(yōu)點(diǎn)及局限性
 4.5.3 肽序列標(biāo)簽鑒定技術(shù)
 4.5.4 18O標(biāo)記從頭測序技術(shù)
 4.5.5 其他蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)
 本章小結(jié)
 思考題
 參考文獻(xiàn)
第5章 蛋白質(zhì)翻譯后修飾
 5.1 磷酸化蛋白質(zhì)的鑒定
 5.1.1 概述
 5.1.2 磷酸化蛋白質(zhì)的檢測方法
 5.1.3 磷酸化蛋白質(zhì)或多肽的分離與富集
 5.1.4 磷酸化蛋白質(zhì)的質(zhì)譜檢測與分析
 5.2 糖基化蛋白質(zhì)的鑒定
 5.2.1 概述
 5.2.2 糖基化蛋白質(zhì)的種類
 5.2.3 糖基化蛋白質(zhì)的分離與富集技術(shù)
 5.2.4 糖基化蛋白質(zhì)的解析
 本章小結(jié)
 思考題
 參考文獻(xiàn)
第6章 蛋白質(zhì)組學(xué)的定量研究技術(shù)
 6.1 熒光定量蛋白質(zhì)分析技術(shù)
 6.1.1 熒光染料染色技術(shù)
 6.1.2 2D-DIGE蛋白質(zhì)組技術(shù)
 6.2 基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組定量分析技術(shù)
 6.2.1 代謝標(biāo)記
 6.2.2 提取后標(biāo)記
 6.2.3 非同位素標(biāo)記定量分析
 6.2.4 用AQuA肽絕對定量
 6.3 蛋白質(zhì)芯片技術(shù)
 6.3.1 蛋白質(zhì)芯片的分類
 6.3.2 蛋白質(zhì)芯片的應(yīng)用
 本章小結(jié)
 思考題
 參考文獻(xiàn)
第7章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析技術(shù)
 7.1 蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)
 7.1.1 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的組織層次
 7.1.2 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的實(shí)驗(yàn)測定及結(jié)構(gòu)基因組學(xué)
 7.1.3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的分類
 7.1.4 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
 7.2 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)比對
 7.2.1 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)比對的原理
 7.2.2 常用的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)比對方法
 7.3 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
 7.3.1 常用的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測方法
 7.3.2 不同二級結(jié)構(gòu)預(yù)測方法的評價
 7.3.3 二級結(jié)構(gòu)預(yù)測的展望
 7.4 蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
 7.4.1 同源模擬
 7.4.2 折疊識別
 7.4.3 從頭計算法
 本章小結(jié)
 思考題
 參考文獻(xiàn)
第8章 互作蛋白質(zhì)組研究技術(shù)
 8.1 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的離體研究技術(shù)
 8.1.1 蛋白質(zhì)親和層析
 8.1.2 表面等離子共振技術(shù)
 8.2 酵母雙雜交技術(shù)
 8.2.1 酵母雙雜交技術(shù)的原理
 8.2.2 酵母雙雜交技術(shù)的試驗(yàn)流程
 8.2.3 酵母雙雜交技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)
 8.2.4 雙雜交技術(shù)的新進(jìn)展
 8.3 免疫共沉淀技術(shù)
 8.3.1 免疫共沉淀法的原理
 8.3.2 免疫共沉淀法的實(shí)驗(yàn)流程
 8.3.3 免疫共沉淀技術(shù)的應(yīng)用
 8.4 藍(lán)色非變性膠技術(shù)
 8.4.1 BN—PAGE技術(shù)的原理
 8.4.2 BN—PAGE技術(shù)的實(shí)驗(yàn)流程
 8.4.3 BN—PAGE的應(yīng)用
 本章小結(jié)
 思考題
 參考文獻(xiàn)
第9章 蛋白質(zhì)組信息學(xué)
 9.1 蛋白質(zhì)組信息學(xué)簡介
 9.1.1 蛋白質(zhì)組信息學(xué)的產(chǎn)生與發(fā)展
 9.1.2 蛋白質(zhì)組信息學(xué)的研究內(nèi)容
 9.2 蛋白質(zhì)組信息學(xué)資源
 9.2.1 蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫
 9.2.2 蛋白質(zhì)模式模體數(shù)據(jù)庫PROSITE
 9.2.3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫
 9.2.4 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類數(shù)據(jù)庫
 9.2.5 蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫
 9.2.6 蛋白質(zhì)功能信息學(xué)數(shù)據(jù)庫
 9.3 蛋白質(zhì)組信息學(xué)技術(shù)的應(yīng)用
 9.3.1 序列比對
 9.3.2 結(jié)構(gòu)預(yù)測
 9.3.3 藥物篩選及設(shè)計
 本章小結(jié)
 思考題
 參考文獻(xiàn)

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